숙근초원은 각종 여러해살이 식물들이 혼합 식재된 정원으로 분수광장 왼쪽 일본정원쪽의 온실 주변부에 넓게 자리잡고 있다. 언제나 자연스러운 정원의 아름다움을 완상할 수 있는 이곳에서는 오니소갈룸과 작약 품종들, 니포피아와 버들마편초, 아네모네와 펜스테몬 등이 계절마다 피고지어 보는 사람들을 즐겁게 해준다. 잔디광장부분까지 3-4단의 현무암으로 조성된 플라워베드에는 목련 품종과 오구나무 아래 한라부추, 원추리, 사초류 등 우리나라 식물 위주로 식재되어 있고 국내외 많은 식물원들과 교류하고 있는 품종이나 해외에서 구입한 품종들을 보강·식재하여 대표적인 옥외정원으로 만들어 가고 있다.