제주자생식물원은 아열대로부터 온대, 한대에까지 이르는 2,000여 종의 다양한 식물자원의 보고인 제주 지역에서 자생하는 식물들을 전시하여 다양성과 풍요로움을 일깨워주는 정원이다.
담팔수와 박달목서 같은 상록활엽수, 참빗살나무와 솔비나무 같은 낙엽활엽수, 비자나무 같은 상록침엽수 등을 만날 수 있고 지역에 자생하는 복수초, 순비기 같은 야생식물뿐만 아니라 파초일엽과 같은 양치식물, 죽백란, 삼백초 등 많은 멸종위기식물들과 문주란, 제주상사화 같은 희귀야생식물들을 찾아볼 수 있는 곳이다. 입구의 돌하르방 상을 지나 걷다 보면 산딸기와 둥굴레 열매와도 쉽게 마주칠 수 있다.