일본정원은 회유형 연못과, 돌다리, 붉은 색깔의 나무다리, 다실과 석등을 갖춘 16세기 양식의 전통 정원과 자연을 정원에 축소시켜 표현한 축경식 정원인 고산수 정원으로 구성되어 있다. 이 정원의 입구부에는 조팝나무와 애기동백, 아이리스 등이 식재되어 있고 중심부에는 꽃창포와 수국 등이 심어져 있는 커다란 연못에 수많은 비단잉어 떼가 노닐고 있으며 금목서, 단풍나무, 왕벚나무 등이 그 골격을 이루고 있어 고요하고 고적하기도 하다. 출구 쪽으로는 산진달래와 삼색조팝 등이 가막살나무, 사람주나무들과 어우러져 있으며 그 옆으로는 털진달래와 참꽃나무 군락 등 진달래 품종을 모아놓은 아담한 진달래원이 자리잡고 있다.